A EJE/TSE mantém parceiros, por meio de acordos de cooperação. Atualmente estão em vigor os seguintes acordos:
Celebrado entre o Tribunal Superior Eleitoral – TSE, por intermédio da Escola Judiciária Eleitoral, e a Escola Nacional de Aperfeiçoamento de Magistrados Ministro Sálvio de Figueiredo Teixeira – Enfam.
Celebrado entre o Tribunal Superior Eleitoral – TSE e o Ministério da Justiça e Segurança Pública, por intermédio da Polícia Federal e da a Diretoria de Ensino da Academia Nacional de Polícia.
Celebrado entre o Tribunal Superior Eleitoral – TSE, por intermédio da Escola Judiciária Eleitoral, e a Advocacia-Geral da União – AGU, por intermédio da Escola Superior da Advocacia-Geral da União – ESAGU.